《神画奇踪影片讲述的是几百年前一个镖师（王洪祥饰演）押送至古曹州府（菏泽古称曹州）一幅绝美的牡丹画卷，途中被一群黑衣人劫持。一番激战后，镖师跌落山崖，劫匪欣喜若狂的在崖边打开牡丹画卷，被画卷所发出的正义之光刺射的双眼流血，画卷掉落山崖而不知所踪。画卷的再次出现，是在几百年后的一场拍卖会上，拍卖师宣称画卷不但精美绝伦，其发出的神奇之光可包治百病。由国内当红新星张雪艳饰演的女一号珊灵与张和利饰演的黑社...

明朝天启年间，左都御史杨涟因得罪魏忠贤含冤入狱，魏忠贤授意东厂及锦衣卫秘密将杨家灭门，徐长卿受王冬青所托秘密救援杨涟孙女杨紫萱，长卿舍身护送紫萱从应山府逃到龙泉村同仁医馆投靠刘谦，刘谦感念恩师杨涟恩情，将紫萱收作关门弟子细心照顾并传授其医学知识，此后几个人将医馆生意打理的井井有条，没想到却引来同行郎中吴南星的嫉妒，最后惊动魏忠贤党羽，魏忠贤得知杨紫萱踪迹派出多批杀手奔医馆而来，只为将杨家孤女紫萱和...